一个普通的无尘净化车间，会涉及到净化装饰、地面、净化空调与通风系统、冷热源系统、照明系统、动力系统、通信系统、监控系统、自动化控制系统、给排水系统、工艺管道系统等工程。无菌车间比普通的无尘净化车间会更复杂，净化车间，需要考量的因素更多。普通的净化工程公司，难以良好完成无菌GMP净化工程建设，实验室净化车间，建议选择的公司来承建。
无菌操作区域内的100级洁净区内的空气在其使用点处应经过滤器过滤后呈单向流态(层流)输送，流速应满足空气以活塞的方式吹除灌封区内的悬浮粒子的需要。按规定，垂直单向流的气流速度为3.5m/s±20%，水平单向流的气流速度为4.5m/s±20%。
以无菌药品车间为例，药品无菌厂房洁净区一般设置为四个洁净级别区。高风险操作区，通常用层流操作台(罩)来维持该区的环境状态。层流系统在其工作区域必须均匀送风，车间净化装修，风速为0.36-0.54m/s(指导值)。 B级，指无菌配制和灌装等高风险操作区所处的背景区域。 C级和D级，指生产无菌药品过程中重要程度较低的洁净操作区。
净化工程在清洗方面注意事项
净化工程目前电子制造，电子厂净化车间，如液晶、磁头、光学、半导体等行业都采用胶盒或防静电胶盒来盛装半成品和成品，这些胶盒一般由PVC、PE、PP等材料制成，有较好的硬度及强度，适合再生清洗，清洗后的胶盒不但品质不受影响，还大大降低了采购成本，又保护了环境，是一举数得的好事，如导电托盘、防静电托盘、IC托盘、液晶托盘、电子产品托盘、周转胶盒、光学塑胶周转盒、电子塑胶周转盒、硅片周转盒等都适用于再生清洗。
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